В Японии, захваченной и переименованной в «Зону 11», вместе с младшей сестрой живёт старшеклассник Лелуш — изгнанный сын Императора, потерявший мать и право на престол. Юноша отличается от сверстников не только происхождением — он весьма одарённая личность, только где применить эти способности? Неожиданно Лелуш оказывается вовлечён в столкновение между японскими террористами и британскими солдатами. Так он знакомится с загадочной девушкой «C.C.» Она дарует ему сверхъестественную способность «Гиасс», позволяющую подчинять себе волю других людей.

Планета Земля и ее отражение — параллельная виртуальная вселенная Лиоко — вновь находятся под угрозой уничтожения! Ульрих, Юми, Од, Джереми и Аэлита — обычные подростки, но в виртуальном мире Лиоко они супергерои. Друзья не побоялись бросить вызов и сразиться с Суперкомпьютером, угрожавшим Лиоко и планете Земля. После непростых испытаний герои, наконец, возвращаются к повседневной жизни. Однако совсем скоро они замечают, что враг по-прежнему не дремлет. Непостижимым образом возрожденные виртуальные монстры стали еще сильнее и опаснее. К друзьям присоединяется шестой Лиоко-воин Уильям Данбар и девочка-гений Лаура Готье. Отважная семерка возвращается в виртуальный мир Лиоко, чтобы сразиться с мощным Компьютером, который в очередной раз ставит мир под угрозу. Список серий: