Аомори, Япония. В месте, славящемся своей прекрасной природой, начинают происходить поистине странные вещи. Пятнадцатилетняя Макото Ковата – профессиональная ведьма. Вместе со своим чёрным котом, Чито, она уехала из Йокогамы к родственникам в Аомори, где должны начаться её ведьминские учения. И пускай её способности пока ограничиваются одним лишь полётом, она, вместе со своими двоюродными братьями, Кеем и Чинатсу, проживают каждый свой день на полную.

В будущем свое место среди достижений инновационных технологий займет недоработанная система «Кизуна» (яп. 絆 — «связь»). Смысл ее в том, что, если человек, в которого вживлен «Кизуна»-чип, получает ранение, другие люди с такими же чипами оказываются ранены идентичным образом. В буквальном смысле связывая людей через раны, создатели системы хотят достичь мира во всем мире. Людей-обладателей чипа «Кизуна» называют кизнайверами. События аниме развиваются в вымышленном японском городе Сугомори-Сити. Город этот непростой, а возведенный на мелиорированных землях, и население которого стремительно сокращается. Недавно переведенная в новую школу Норико Сонозаки сообщает своему однокласснику, Кацухире Агате, что планы на его летние каникулы немного подкорректировали — он избран в качестве кизнайвера. С этих пор юноша будет связан с одноклассниками-кизнайверами. Но есть одна проблема: все они ведут непредсказуемый образ жизни, что в корне не устраивает нелюдимого Кацухиру.