Казалось, зло побеждено раз и навсегда. Мальчишки наслаждаются отдыхом после заслуженной победы. Но неожиданно приходят известия о вирусе, который снова начал проникать в компьютерные сети пользователей по всей стране. Япония находится в опасности. Заражаются даже телевизоры и мобильные устройства, если они имеют доступ во всемирную паутину. Насколько всё плохо, стало понятно, когда выяснилось, кто их противник. В реальный мир снова пытается вырваться Дьяволомон. Сейчас он ищет тех единственных, кто может ему противостоять. Научившись создавать своих клонов, он рассылает их по городам, чтобы уничтожить всю компанию.

Продолжение приключений дигимонов. Наших славных героев ждёт встреча с новой, им неведомой, силой, которая способна уничтожить любого человека и дигимона внутри себя. А всё потому, что сердце этого дигимона черно, как ночь. Смогут ли Избранные остановить эту силу и растопить сердце злого дигимона?

Будучи маленькими, Тайти и Хикари, брат и сестра, стали свидетелями того, как из их компьютера вылезло некое яйцо. Находясь с ним всё больше и больше, они привязались к нему и поняли, что цифровой мир не так прост, как казался с самого начала...

Когда, казалось бы, Цифровой мир уже был защищён от опасности, в интернете появляется новый злой дигимон. Тайти с компанией вновь приходится взяться за дигивайсы и отражать цифровую угрозу, которая может навредить всему человечеству. Вперёд, Тайти! Вперёд, Агумон!

Команда обнаруживает, что, когда они вырастут, их отношения со своим дигимоном подойдут к концу. Они понимают, что чем больше они сражаются, тем быстрее рвется их связь, и время выбора быстро приближается.