Один мир за другим начинают гибнуть миры от рук могущественного зла. Оставшиеся в живых супергерои попадают в параллельную вселенную и объединяются с местной Лигой справедливости и другими героями, чтобы попытаться спасти свой новый дом и одолеть опасного врага.

Анти-Монитор – кровожадный злодей, наделенный сверхчеловеческими способностями. Он стремится к безраздельной власти, и готов пойти на все, лишь бы получить под свой контроль все существующие вселенные. Более того, этот безумец ведет охоту на лучших защитников мира, видя в них единственную угрозу для своих планов.

Лекс Лутор, который явился из параллельного мира, чтобы нанять Лигу Справедливости для борьбы с Криминальным Синдикатом. Противостояние добра и зла приводит обе Земли на край гибели. Рискованный план спасения, похоже, единственный шанс выжить.

Лига Справедливости узнает о том, что Бэтмен в тайне собирает данные о силах и слабостях каждого из участников. Лига принимает решение изгнать Бэтмена из команды. Cобранные им данные попадают в руки Вандала Дикого, намеренного уничтожить участников Лиги Справедливости одного за другим, ударяя по слабым местам супергероев.

В альтернативной вселенной совершенно другие воплощения знаменитой супергеройской троицы после обвинения их в атаке на посольство оказываются в противостоянии с правительством.

Миллионы людей в нашем мире ссорятся по тем или иным причинам. Кто-то умеет мирно разрешать конфликты, кто-то же привык решать все проблемы «на кулаках». Но мало кто верит в существование истинной справедливости, однако команда супергероев всегда готова подтвердить, что справедливость все же, существует. Отважные спасатели бросаются на помощь к тем, кто пострадал от незаконных или нечестных действий злодеев, они очищают мир от негодяев, делая его более добрым и светлым.

Действия мультфильма происходят в 1954 году. Отважные супергерои должны защитить планету не только от людского зла, но и Вселенского. На Землю надвигаются тысячи злых пришельцев. Супермен, Флэш, Зелёный Фонарь, Чудо-Женщина, Бэтмен и многие другие герои отдают свои жизни за родную планету.

Трон Атлантиды» — это прямой сиквел «Лиги Справедливости: Война». Мультфильм расскажет о противостояние Аквамена и его брата Орма Повелителя Океана, который объявил войну жителям поверхности Земли после смерти короля Атлантиды во время инопланетного вторжения. События «Трона Антлантиды» будут разворачиваться вокруг молодого Артура Карри, который узнает о своем происхождении. Теперь он вынужден объединится с Лигой Справедливости, чтобы остановить Орма. Мы знакомимся с Артуром в очень сложный, поворотный момент его жизни. Его отец умирает, и он остается один, он становится изгоем. Когда армия Атлантиды начинает вторжение на поверхность, Артур еще не знаем о своем происхождении. Однако, как только он узнает о своем наследии, то ему предстоит сделать нелегкий выбор, который в итоге определит его судьбу.

Мультфильм повествует о начале возникновения Лиги справедливости. В Готэм-сити загадочным образом исчезают люди, в этом винят Бэтмена. Люди считают, что он похищает людей и пьет их кровь. Зеленый Фонарь, дабы покарать виновника похищения, направляется в Готем и встречает там Бэтмена, но под личиной летучей мыши оказывается инопланетный высокотехнологичный робот. Фонарь и настоящий Бэтмен объединяются для борьбы с роботом, который заложил какой-то предмет в канализации города. Как выясняется позже эти штуки есть ничто иное как кротовые норы (порталы для перемещения между измерениями) для вторжения.

Когда Бэтмен, Супермен и Чудо-женщина сражались с очередным суперзлодеем, что-то происходит и супергерои неведомым образом переносятся в другие миры. Бэтмен попадает в мир фэнтези, Чудо-женщина оказывается на Диком Западе, а Супермен в новом мире лишается суперсил и сталкивается с вторжением агрессивных инопланетян. Здесь героям вновь приходится спасать людей от смертельных опасностей, параллельно пытаясь найти путь к родному дому.

Флэш случайно попадает в прошлое, где встречается с супергероями «старой школы» на полях Второй мировой войны.