Три года прошло с окончания Годичной Войны. Мир на Земле и колониях нарушен присутствием Флота Делаза, военной группировки Зеона, следующей принципам и идеалам покойного диктатора Гирена Заби. Пилот-ас флота Делаза, Анавель Гато, прозванный "Кошмаром Соломона", уничтожает базу Федерации в Австралии - Торрингтон, и крадет оттуда прототип Гандам GP02A "Физалис", оснащенный ядерным оружием. С помощью инженера "Анахейм Электроникс" Нины Пурплейтон и экипажа корабля-носителя "Альбион", пилот-новичок Коу Ураки, ради возвращения украденного Гандама и пресечения начинающейся войны, становится пилотом Гандама Boris

Gundam F-91 - о молодом мальчике по имени Сибук Арно, на колонию которой нападают отряды Скрещенных костей, военизированной организации во главе со странной личностью которую прозвали Железна Маска, за маску которую он никогда не снимает. На спасательном боте Сибук вместе с со своими друзьями сбегает из колонии, где он родился и жил. В это время возлюбленная Сибука, Сесиль выбирает другую сторону военного конфликта и проходит обучение в специальном отряде Скрещенных костей. Аниме хотя и пронизано хорошими обзорами имеет немного затянутый сюжет. Требуется приблизительно 45 минут для того, что б Сибук получил F-91, недавно разработанный мобильный доспех, оборудованный VSBR, специальной высокочастотной винтовкой, которая пробивает новейшие щиты антилуча и вместе с военными начал защищать соседнюю колонию Фронтир-1.