Около вулкана маленький мальчик случайно вызывает обвал, обнаживший голову Драготрона. Предакон просыпается и пробуждает ото сна остальных представителей своего рода. Оптимус Прайм засекает пять сигналов предаконов, а также шесть автоботских, и недоумевает, что это может означать. В Токио мальчик Исами Татеваки и его дедушка подвергаются нападению предаконов, желающих забрать Легендиск, но школьник с помощью артефакта пробуждает команду самураев. В то же время его друг Тобио Фума оживляет команду ниндзя. Вместе дети и автоботы должны остановить разбушевавшихся предаконов.

Вернувшись на Кибертрон, Максималы узнают, что он захвачен предаконом Мегатроном и его армией механических Дронов. Так начинается война между органикой и техникой.

Закончилась первая война Максималов с Предаконами, и обе армии решили возвратиться на Кибертрон. Но Мегатрон оказался проворнее Максималов. Он гораздо раньше их вернулся на свою родную планету и создал компьютерный вирус, который максимально приблизил его к осуществлению его заветной мечты – к полному порабощению Кибертрона. Вирус действовал на всех трансформеров таким образом, что физическая оболочка просто отключалась, а Искра выходила наружу и могла быть использована Мегатроном. Мегатрон извел таким образом почти всех трансформеров на Кибертроне (которые были в тот момент там – в космос он не полез). Но этого ему показалось мало. Он решил, что новому Императору Кибертрона позорно оставаться «органическим», и он решил переделать себя в машину. Но так как в его теле сосуществовали две Искры, стать чистой машиной ему так и не удалось. Временами, когда он не мог контролировать свою Искру, предаконское «Я» - звериное, драконье – выходило наружу, и Мегатрон превращался в дикого зверя, монстра, не способного отвечать за свои поступки и крушащего все на своем пути. Мегатрон создал себе новую армию – армию вехиконов, армию, состоящую из миллионов безмозглых, но очень сильных трансформеров.