Коты - Самураи это истории о приключениях тройки неразлучных друзей, Спиди, Гуидо и Полли. Во главе с полковником Эл`Данте и их координатором Франсин они защищают Маленький Токио и его жителей от козней Сырной Головы и его приспешников, который насылает роботов чтобы победить и уничтожить котов - самураев, а также захватить власть в свои руки и свергнуть императора Фреда и его дочь, принцессу Вай, которая фактически и управляет Маленьким Токио после того как императору удалили "зуб мудрости" и он сошёл с ума и не говорит ничего кроме своего имени. Но наши храбрые герои не дадут спуску врагу, и всегда защитят город и его жителей от надвигающейся беды и всегда побеждают врагов, чтобы жизнь в Маленьком Токио была спокойной и безопасной. А в свободное от ратных дел время наши друзья работают в пиццерии.

Обожаемая детьми во всем мире героическая четверка, полная неукротимой энергии, отправляется в мультприключения, расправляясь с негодяями, выслеживая злодеев и поглощая пиццу в безостановочном темпе.

Альтернативный мир. Сон Гоку — молодой воин, мастер боевых искусств, могущий превращаться в обезьяну-оборотня. Вместе с друзьями он задумал собрать вместе семь драконьих жемчужин — с их помощью можно вызвать дракона Шенлонга, который выполнит любое желание заклинателя. Однако после выполнения желания жемчужины рассеиваются по всему миру…

Сюжет мультсериала повествует о войне за территорию двух фракций живых роботов с планеты Кибертрон — Автоботов и Десептиконов. В ходе войны природные ресурсы их родной планеты Кибертрон исчерпываются. Чтобы выжить представителям обеих рас приходится бороздить космос в поисках новых ресурсов. Попав на планету Земля войска Оптимуса Прайма и Мегатрона продолжают свою борьбу в 1984 году, скрываясь от людей под камуфляжем доминирующей земной формы — машинной технике. Однако вскоре их война перестаёт быть тайной.